U flori Marjana utvrđene su 23 biljne svojte, koje pripadaju kategoriji strogo zaštićenih vrsta, prema Pravilniku o strogo zaštićenim vrstama (NN 144/13 i 73/16), to su:
– Aurinia leucadea (Guss.) K. Koch – jadranska gromotulja
– Aurinia sinuata (L.) Griseb – izverugana gromotulja
– Blackstonia perfoliata (L.) Huds. ssp. serotina (Rchb.) Vollm. – trožilna žuška
– Carduus micropterus (Borbás) Teyber ssp. micropterus – uspravni stričak
– Centaurea ragusina L. – dubrovačka zečina
– Centaurea spinosociliata Seenus – trnovitotrepavičava zečina
– Chaerophyllum coloratum L. – obojena krabljica
– Limonium cancellatum (Bernh. ex Bertol.) Kuntze – rešetkasta mrižica
– Vincetoxicum hirundinaria Medik. ssp. adriaticum (Beck) Markgr. – jadranska lastavina
– Tanacetum cinerariifolium (Trevir.) Sch.Bip. – buhač
– Cymodocea nodosa (Ucria) Asch. – morska resa
– Trifolium dalmaticum Vis. – dalmatinska djetelina
– Gladiolus illyricus W. D. J. Koch – ilirska gladiola
– Hibiscus trionum L. – vršača sljezolika
– Ophrys sphegodes Mill. – kokica paučica
– Goniolimon dalmaticum (C. Presl) Rchb. f. – dalmatinski vražemil
– Genista sylvestris Scop. ssp. dalmatica (Bartl.) H. Lindb. – dalmatinska žutilovka
– Limonium cancellatum (Bernh. ex Bertol.) Kuntze – rešetkasta mrižica
– Arundo plinii Turra – plinijev trst
– Delphinium peregrinum L. – strani veliki kokotić
– Parapholis incurva (L.) C. E. Hubb. – svinuti tankorepaš
– Onosma echioides (L.) L. ssp. dalmatica (Scheele) Peruzzi et N. G. Passal.
– dalmatinski oštrolist
– Linaria microsepala A. Kern. – bljedoljubičasti lanilist
– Consolida ajacis (L.) Schur – vrtni kokotić